Konusu On yıl önce, Ryouta Murakami, yabancı yaşamın kanıtını bulmak için en iyi arkadaşı Kuroneko ile yola çıktı. Kuroneko'yu öldüren ve Ryouta'yı yaralayan trajik bir kaza oldu. Kuroneko'nun anısına onur duyan Ryouta artık, arkadaşının doğru olduğunu ve uzaylıların gerçekten var olduğunu kanıtlamaya kararlı, uzaylı işaretleri için gece gökyüzünü araştırıyor.
Sonra bir gün yeni bir transfer öğrencisi sınıfa gelir ve inandığı her şeyi paramparça eder: adı Kuroha Neko ve ölen Kuroneko'ya benziyor. Kuroha, Ryouta'nın arkadaşı olmayı reddediyor, ama onun hakkında garip bir şeyler var. Her nasılsa aktarılması zor bir sınavdan geçti, ama çarpım tablosunu bilmiyor. İnsanlık dışı bir güce ve tuhaf yeteneklere sahip. Ve hepsinden tuhaf, ölümü tahmin ediyor.
Kuroha hayatını kurtarmak için doğaüstü bir güç gösterdikten sonra, Ryouta Kuroha'nın hayatının bir parçası haline gelir, geçmişi ve evrende var olan gizli güçleri öğrenir. Yapay olarak yaratılmış cadılar ve sihir dünyasına gittikçe daha fazla battığından, Ryouta bilimsel aklının Kuroha'nın çok gerçek bir güce sahip olduğunu kabul etmesine izin vermelidir - bazı güçlerin elde edemeyeceği hiçbir şeyde durmayacak gücü.